Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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