Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDKN3Q16667 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
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