Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NTRK3Q16288 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NTRK3Q16288 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NTRK3Q16288 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NTRK3Q16288 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NTRK3Q16288 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NTRK3Q16288 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NTRK3Q16288 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NTRK3Q16288 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NTRK3Q16288 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NTRK3Q16288 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NTRK3Q16288 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NTRK3Q16288 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NTRK3Q16288 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NTRK3Q16288 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NTRK3Q16288 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NTRK3Q16288 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NTRK3Q16288 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NTRK3Q16288 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NTRK3Q16288 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NTRK3Q16288 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NTRK3Q16288 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NTRK3Q16288 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NTRK3Q16288 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NTRK3Q16288 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NTRK3Q16288 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NTRK3Q16288 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NTRK3Q16288 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NTRK3Q16288 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NTRK3Q16288 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NTRK3Q16288 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NTRK3Q16288 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NTRK3Q16288 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NTRK3Q16288 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NTRK3Q16288 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NTRK3Q16288 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NTRK3Q16288 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NTRK3Q16288 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NTRK3Q16288 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NTRK3Q16288 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NTRK3Q16288 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NTRK3Q16288 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NTRK3Q16288 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NTRK3Q16288 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NTRK3Q16288 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NTRK3Q16288 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NTRK3Q16288 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NTRK3Q16288 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NTRK3Q16288 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NTRK3Q16288 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NTRK3Q16288 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NTRK3Q16288 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NTRK3Q16288 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NTRK3Q16288 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NTRK3Q16288 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NTRK3Q16288 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NTRK3Q16288 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NTRK3Q16288 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NTRK3Q16288 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NTRK3Q16288 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NTRK3Q16288 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NTRK3Q16288 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NTRK3Q16288 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NTRK3Q16288 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NTRK3Q16288 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NTRK3Q16288 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NTRK3Q16288 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NTRK3Q16288 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NTRK3Q16288 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NTRK3Q16288 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NTRK3Q16288 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NTRK3Q16288 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NTRK3Q16288 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NTRK3Q16288 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NTRK3Q16288 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NTRK3Q16288 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NTRK3Q16288 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NTRK3Q16288 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NTRK3Q16288 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NTRK3Q16288 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NTRK3Q16288 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NTRK3Q16288 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NTRK3Q16288 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NTRK3Q16288 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NTRK3Q16288 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NTRK3Q16288 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NTRK3Q16288 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NTRK3Q16288 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NTRK3Q16288 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NTRK3Q16288 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NTRK3Q16288 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NTRK3Q16288 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NTRK3Q16288 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NTRK3Q16288 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NTRK3Q16288 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NTRK3Q16288 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NTRK3Q16288 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NTRK3Q16288 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NTRK3Q16288 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NTRK3Q16288 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
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