Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATP6AP1Q15904 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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