Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPTX1Q15818 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms