Protein–RNA interactions for Protein: Q15544

TAF11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF11Q15544 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TAF11Q15544 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TAF11Q15544 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TAF11Q15544 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TAF11Q15544 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TAF11Q15544 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TAF11Q15544 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TAF11Q15544 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TAF11Q15544 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TAF11Q15544 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TAF11Q15544 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TAF11Q15544 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TAF11Q15544 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TAF11Q15544 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TAF11Q15544 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TAF11Q15544 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TAF11Q15544 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TAF11Q15544 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TAF11Q15544 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TAF11Q15544 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TAF11Q15544 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TAF11Q15544 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TAF11Q15544 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TAF11Q15544 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TAF11Q15544 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TAF11Q15544 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TAF11Q15544 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TAF11Q15544 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TAF11Q15544 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TAF11Q15544 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TAF11Q15544 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TAF11Q15544 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TAF11Q15544 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TAF11Q15544 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TAF11Q15544 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TAF11Q15544 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TAF11Q15544 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TAF11Q15544 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TAF11Q15544 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TAF11Q15544 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TAF11Q15544 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TAF11Q15544 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TAF11Q15544 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TAF11Q15544 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TAF11Q15544 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TAF11Q15544 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TAF11Q15544 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TAF11Q15544 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TAF11Q15544 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TAF11Q15544 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TAF11Q15544 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TAF11Q15544 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TAF11Q15544 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TAF11Q15544 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TAF11Q15544 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TAF11Q15544 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TAF11Q15544 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TAF11Q15544 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TAF11Q15544 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TAF11Q15544 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TAF11Q15544 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TAF11Q15544 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TAF11Q15544 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TAF11Q15544 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TAF11Q15544 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TAF11Q15544 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TAF11Q15544 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TAF11Q15544 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TAF11Q15544 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TAF11Q15544 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TAF11Q15544 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TAF11Q15544 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TAF11Q15544 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TAF11Q15544 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TAF11Q15544 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TAF11Q15544 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TAF11Q15544 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TAF11Q15544 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TAF11Q15544 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TAF11Q15544 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TAF11Q15544 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TAF11Q15544 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TAF11Q15544 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TAF11Q15544 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TAF11Q15544 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TAF11Q15544 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TAF11Q15544 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TAF11Q15544 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TAF11Q15544 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TAF11Q15544 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TAF11Q15544 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TAF11Q15544 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TAF11Q15544 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TAF11Q15544 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TAF11Q15544 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TAF11Q15544 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TAF11Q15544 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TAF11Q15544 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TAF11Q15544 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TAF11Q15544 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms