Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GBX1Q14549 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
GBX1Q14549 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
GBX1Q14549 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
GBX1Q14549 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GBX1Q14549 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GBX1Q14549 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GBX1Q14549 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GBX1Q14549 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GBX1Q14549 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GBX1Q14549 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GBX1Q14549 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GBX1Q14549 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GBX1Q14549 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GBX1Q14549 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GBX1Q14549 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GBX1Q14549 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GBX1Q14549 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GBX1Q14549 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GBX1Q14549 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GBX1Q14549 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GBX1Q14549 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GBX1Q14549 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GBX1Q14549 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GBX1Q14549 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GBX1Q14549 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GBX1Q14549 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GBX1Q14549 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GBX1Q14549 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GBX1Q14549 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GBX1Q14549 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GBX1Q14549 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GBX1Q14549 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GBX1Q14549 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GBX1Q14549 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GBX1Q14549 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GBX1Q14549 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GBX1Q14549 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GBX1Q14549 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GBX1Q14549 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GBX1Q14549 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GBX1Q14549 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GBX1Q14549 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GBX1Q14549 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GBX1Q14549 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GBX1Q14549 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GBX1Q14549 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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GBX1Q14549 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GBX1Q14549 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
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GBX1Q14549 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
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GBX1Q14549 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GBX1Q14549 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GBX1Q14549 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GBX1Q14549 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GBX1Q14549 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GBX1Q14549 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GBX1Q14549 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GBX1Q14549 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GBX1Q14549 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GBX1Q14549 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GBX1Q14549 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GBX1Q14549 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GBX1Q14549 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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GBX1Q14549 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GBX1Q14549 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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GBX1Q14549 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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GBX1Q14549 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GBX1Q14549 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GBX1Q14549 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GBX1Q14549 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GBX1Q14549 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GBX1Q14549 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GBX1Q14549 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GBX1Q14549 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GBX1Q14549 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GBX1Q14549 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GBX1Q14549 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GBX1Q14549 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GBX1Q14549 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GBX1Q14549 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GBX1Q14549 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GBX1Q14549 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GBX1Q14549 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GBX1Q14549 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GBX1Q14549 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GBX1Q14549 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GBX1Q14549 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GBX1Q14549 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GBX1Q14549 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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