Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
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