Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
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