Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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