Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOFQ13790 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOFQ13790 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOFQ13790 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOFQ13790 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOFQ13790 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOFQ13790 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOFQ13790 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOFQ13790 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOFQ13790 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOFQ13790 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOFQ13790 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOFQ13790 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOFQ13790 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOFQ13790 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOFQ13790 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOFQ13790 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOFQ13790 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
APOFQ13790 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOFQ13790 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOFQ13790 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOFQ13790 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOFQ13790 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOFQ13790 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
APOFQ13790 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
APOFQ13790 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
APOFQ13790 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
APOFQ13790 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
APOFQ13790 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
APOFQ13790 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
APOFQ13790 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
APOFQ13790 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
APOFQ13790 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
APOFQ13790 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
APOFQ13790 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
APOFQ13790 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
APOFQ13790 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOFQ13790 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOFQ13790 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOFQ13790 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOFQ13790 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOFQ13790 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOFQ13790 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOFQ13790 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOFQ13790 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOFQ13790 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOFQ13790 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOFQ13790 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOFQ13790 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOFQ13790 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOFQ13790 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOFQ13790 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOFQ13790 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOFQ13790 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOFQ13790 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOFQ13790 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOFQ13790 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOFQ13790 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOFQ13790 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
APOFQ13790 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOFQ13790 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOFQ13790 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOFQ13790 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOFQ13790 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOFQ13790 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOFQ13790 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOFQ13790 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOFQ13790 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOFQ13790 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOFQ13790 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOFQ13790 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOFQ13790 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOFQ13790 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOFQ13790 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOFQ13790 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOFQ13790 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOFQ13790 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOFQ13790 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOFQ13790 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOFQ13790 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOFQ13790 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOFQ13790 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOFQ13790 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOFQ13790 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOFQ13790 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOFQ13790 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOFQ13790 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOFQ13790 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOFQ13790 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOFQ13790 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOFQ13790 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOFQ13790 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
APOFQ13790 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOFQ13790 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOFQ13790 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOFQ13790 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOFQ13790 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOFQ13790 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOFQ13790 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOFQ13790 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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