Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CUL1Q13616 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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