Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms