Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

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Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEMA3FQ13275 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEMA3FQ13275 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SEMA3FQ13275 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEMA3FQ13275 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SEMA3FQ13275 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SEMA3FQ13275 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEMA3FQ13275 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEMA3FQ13275 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEMA3FQ13275 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEMA3FQ13275 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEMA3FQ13275 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEMA3FQ13275 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEMA3FQ13275 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEMA3FQ13275 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA3FQ13275 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA3FQ13275 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA3FQ13275 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA3FQ13275 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA3FQ13275 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA3FQ13275 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA3FQ13275 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA3FQ13275 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA3FQ13275 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA3FQ13275 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA3FQ13275 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA3FQ13275 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA3FQ13275 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA3FQ13275 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA3FQ13275 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA3FQ13275 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA3FQ13275 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA3FQ13275 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA3FQ13275 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA3FQ13275 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA3FQ13275 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA3FQ13275 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA3FQ13275 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA3FQ13275 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEMA3FQ13275 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEMA3FQ13275 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEMA3FQ13275 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEMA3FQ13275 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEMA3FQ13275 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEMA3FQ13275 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEMA3FQ13275 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEMA3FQ13275 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEMA3FQ13275 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEMA3FQ13275 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEMA3FQ13275 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEMA3FQ13275 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEMA3FQ13275 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEMA3FQ13275 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SEMA3FQ13275 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEMA3FQ13275 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEMA3FQ13275 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEMA3FQ13275 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEMA3FQ13275 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEMA3FQ13275 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEMA3FQ13275 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEMA3FQ13275 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEMA3FQ13275 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEMA3FQ13275 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEMA3FQ13275 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEMA3FQ13275 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEMA3FQ13275 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEMA3FQ13275 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEMA3FQ13275 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEMA3FQ13275 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEMA3FQ13275 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEMA3FQ13275 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEMA3FQ13275 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEMA3FQ13275 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEMA3FQ13275 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEMA3FQ13275 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEMA3FQ13275 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEMA3FQ13275 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEMA3FQ13275 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
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