Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
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SEMA3BQ13214 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
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SEMA3BQ13214 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
SEMA3BQ13214 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
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SEMA3BQ13214 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SEMA3BQ13214 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SEMA3BQ13214 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SEMA3BQ13214 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SEMA3BQ13214 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SEMA3BQ13214 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SEMA3BQ13214 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SEMA3BQ13214 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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SEMA3BQ13214 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SEMA3BQ13214 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SEMA3BQ13214 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
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SEMA3BQ13214 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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SEMA3BQ13214 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SEMA3BQ13214 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SEMA3BQ13214 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SEMA3BQ13214 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SEMA3BQ13214 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SEMA3BQ13214 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SEMA3BQ13214 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SEMA3BQ13214 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SEMA3BQ13214 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SEMA3BQ13214 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
SEMA3BQ13214 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SEMA3BQ13214 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SEMA3BQ13214 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SEMA3BQ13214 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SEMA3BQ13214 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
SEMA3BQ13214 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
SEMA3BQ13214 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SEMA3BQ13214 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SEMA3BQ13214 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SEMA3BQ13214 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SEMA3BQ13214 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SEMA3BQ13214 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SEMA3BQ13214 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SEMA3BQ13214 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
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