Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
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