Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXF2Q12947 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXF2Q12947 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXF2Q12947 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXF2Q12947 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXF2Q12947 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXF2Q12947 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXF2Q12947 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXF2Q12947 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXF2Q12947 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXF2Q12947 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
FOXF2Q12947 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
FOXF2Q12947 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
FOXF2Q12947 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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FOXF2Q12947 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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FOXF2Q12947 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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FOXF2Q12947 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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