Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
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