Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms