Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms