Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms