Protein–RNA interactions for Protein: Q01518

CAP1, Adenylyl cyclase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAP1Q01518 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAP1Q01518 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAP1Q01518 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAP1Q01518 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAP1Q01518 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAP1Q01518 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAP1Q01518 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAP1Q01518 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAP1Q01518 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAP1Q01518 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAP1Q01518 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAP1Q01518 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAP1Q01518 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAP1Q01518 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAP1Q01518 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAP1Q01518 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAP1Q01518 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAP1Q01518 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAP1Q01518 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CAP1Q01518 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAP1Q01518 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAP1Q01518 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAP1Q01518 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAP1Q01518 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAP1Q01518 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CAP1Q01518 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAP1Q01518 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAP1Q01518 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAP1Q01518 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAP1Q01518 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAP1Q01518 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAP1Q01518 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAP1Q01518 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAP1Q01518 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAP1Q01518 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAP1Q01518 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAP1Q01518 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAP1Q01518 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAP1Q01518 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CAP1Q01518 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAP1Q01518 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAP1Q01518 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAP1Q01518 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAP1Q01518 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CAP1Q01518 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAP1Q01518 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAP1Q01518 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAP1Q01518 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAP1Q01518 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAP1Q01518 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAP1Q01518 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CAP1Q01518 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAP1Q01518 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAP1Q01518 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAP1Q01518 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CAP1Q01518 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAP1Q01518 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAP1Q01518 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CAP1Q01518 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAP1Q01518 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAP1Q01518 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAP1Q01518 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAP1Q01518 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CAP1Q01518 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CAP1Q01518 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAP1Q01518 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAP1Q01518 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAP1Q01518 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAP1Q01518 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAP1Q01518 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAP1Q01518 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAP1Q01518 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAP1Q01518 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAP1Q01518 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAP1Q01518 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAP1Q01518 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAP1Q01518 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAP1Q01518 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAP1Q01518 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAP1Q01518 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAP1Q01518 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAP1Q01518 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAP1Q01518 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAP1Q01518 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAP1Q01518 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAP1Q01518 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAP1Q01518 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAP1Q01518 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAP1Q01518 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAP1Q01518 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAP1Q01518 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAP1Q01518 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAP1Q01518 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAP1Q01518 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CAP1Q01518 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAP1Q01518 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAP1Q01518 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAP1Q01518 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAP1Q01518 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAP1Q01518 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms