Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GTF2BQ00403 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GTF2BQ00403 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GTF2BQ00403 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GTF2BQ00403 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GTF2BQ00403 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
GTF2BQ00403 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GTF2BQ00403 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GTF2BQ00403 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GTF2BQ00403 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GTF2BQ00403 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GTF2BQ00403 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GTF2BQ00403 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GTF2BQ00403 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GTF2BQ00403 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GTF2BQ00403 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GTF2BQ00403 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GTF2BQ00403 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GTF2BQ00403 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GTF2BQ00403 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GTF2BQ00403 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GTF2BQ00403 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GTF2BQ00403 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GTF2BQ00403 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GTF2BQ00403 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GTF2BQ00403 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GTF2BQ00403 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GTF2BQ00403 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GTF2BQ00403 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GTF2BQ00403 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GTF2BQ00403 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GTF2BQ00403 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GTF2BQ00403 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GTF2BQ00403 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GTF2BQ00403 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GTF2BQ00403 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GTF2BQ00403 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
GTF2BQ00403 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GTF2BQ00403 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GTF2BQ00403 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GTF2BQ00403 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GTF2BQ00403 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GTF2BQ00403 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GTF2BQ00403 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GTF2BQ00403 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GTF2BQ00403 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GTF2BQ00403 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GTF2BQ00403 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GTF2BQ00403 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GTF2BQ00403 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GTF2BQ00403 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GTF2BQ00403 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GTF2BQ00403 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GTF2BQ00403 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GTF2BQ00403 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GTF2BQ00403 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GTF2BQ00403 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GTF2BQ00403 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GTF2BQ00403 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GTF2BQ00403 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GTF2BQ00403 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GTF2BQ00403 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GTF2BQ00403 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GTF2BQ00403 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GTF2BQ00403 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GTF2BQ00403 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GTF2BQ00403 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GTF2BQ00403 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GTF2BQ00403 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GTF2BQ00403 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GTF2BQ00403 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GTF2BQ00403 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GTF2BQ00403 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
GTF2BQ00403 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GTF2BQ00403 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
GTF2BQ00403 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GTF2BQ00403 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GTF2BQ00403 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GTF2BQ00403 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GTF2BQ00403 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GTF2BQ00403 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GTF2BQ00403 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GTF2BQ00403 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GTF2BQ00403 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GTF2BQ00403 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GTF2BQ00403 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GTF2BQ00403 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GTF2BQ00403 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GTF2BQ00403 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GTF2BQ00403 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GTF2BQ00403 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GTF2BQ00403 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GTF2BQ00403 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GTF2BQ00403 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GTF2BQ00403 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GTF2BQ00403 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GTF2BQ00403 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GTF2BQ00403 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
GTF2BQ00403 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GTF2BQ00403 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms