Protein–RNA interactions for Protein: P80075

CCL8, C-C motif chemokine 8, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL8P80075 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCL8P80075 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCL8P80075 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCL8P80075 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCL8P80075 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCL8P80075 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCL8P80075 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCL8P80075 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCL8P80075 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCL8P80075 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCL8P80075 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCL8P80075 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCL8P80075 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCL8P80075 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCL8P80075 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCL8P80075 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCL8P80075 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCL8P80075 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCL8P80075 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCL8P80075 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCL8P80075 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCL8P80075 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCL8P80075 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCL8P80075 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCL8P80075 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCL8P80075 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCL8P80075 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCL8P80075 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCL8P80075 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCL8P80075 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCL8P80075 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCL8P80075 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCL8P80075 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCL8P80075 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCL8P80075 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCL8P80075 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCL8P80075 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCL8P80075 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCL8P80075 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCL8P80075 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCL8P80075 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCL8P80075 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCL8P80075 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCL8P80075 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCL8P80075 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CCL8P80075 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCL8P80075 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCL8P80075 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCL8P80075 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCL8P80075 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCL8P80075 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCL8P80075 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCL8P80075 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCL8P80075 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCL8P80075 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCL8P80075 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCL8P80075 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCL8P80075 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCL8P80075 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCL8P80075 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCL8P80075 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCL8P80075 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCL8P80075 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCL8P80075 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCL8P80075 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCL8P80075 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCL8P80075 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCL8P80075 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL8P80075 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL8P80075 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL8P80075 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL8P80075 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL8P80075 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL8P80075 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL8P80075 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL8P80075 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL8P80075 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL8P80075 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL8P80075 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL8P80075 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL8P80075 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL8P80075 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL8P80075 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL8P80075 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL8P80075 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL8P80075 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL8P80075 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL8P80075 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL8P80075 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL8P80075 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL8P80075 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL8P80075 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL8P80075 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL8P80075 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL8P80075 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL8P80075 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL8P80075 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL8P80075 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL8P80075 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL8P80075 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms