Protein–RNA interactions for Protein: P78348

ASIC1, Acid-sensing ion channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC1P78348 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ASIC1P78348 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ASIC1P78348 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ASIC1P78348 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.33■■□□□ 1
ASIC1P78348 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ASIC1P78348 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms