Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms