Protein–RNA interactions for Protein: P62987

UBA52, Ubiquitin-60S ribosomal protein L40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA52P62987 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBA52P62987 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBA52P62987 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBA52P62987 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBA52P62987 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBA52P62987 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBA52P62987 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBA52P62987 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBA52P62987 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBA52P62987 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBA52P62987 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBA52P62987 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBA52P62987 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBA52P62987 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBA52P62987 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBA52P62987 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBA52P62987 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBA52P62987 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBA52P62987 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBA52P62987 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBA52P62987 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
UBA52P62987 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
UBA52P62987 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBA52P62987 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBA52P62987 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBA52P62987 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBA52P62987 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBA52P62987 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBA52P62987 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBA52P62987 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBA52P62987 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBA52P62987 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBA52P62987 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBA52P62987 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBA52P62987 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
UBA52P62987 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBA52P62987 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBA52P62987 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBA52P62987 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBA52P62987 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBA52P62987 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBA52P62987 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBA52P62987 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBA52P62987 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBA52P62987 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBA52P62987 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBA52P62987 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBA52P62987 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
UBA52P62987 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBA52P62987 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBA52P62987 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBA52P62987 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBA52P62987 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBA52P62987 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBA52P62987 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBA52P62987 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBA52P62987 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
UBA52P62987 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBA52P62987 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
UBA52P62987 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBA52P62987 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBA52P62987 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBA52P62987 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBA52P62987 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBA52P62987 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBA52P62987 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBA52P62987 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBA52P62987 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBA52P62987 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBA52P62987 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBA52P62987 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBA52P62987 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBA52P62987 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBA52P62987 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBA52P62987 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBA52P62987 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBA52P62987 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBA52P62987 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBA52P62987 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBA52P62987 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBA52P62987 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBA52P62987 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBA52P62987 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBA52P62987 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
UBA52P62987 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBA52P62987 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBA52P62987 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBA52P62987 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBA52P62987 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBA52P62987 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBA52P62987 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBA52P62987 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBA52P62987 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBA52P62987 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
UBA52P62987 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
UBA52P62987 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
UBA52P62987 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
UBA52P62987 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
UBA52P62987 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBA52P62987 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms