Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HERVK_113P62684 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HERVK_113P62684 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HERVK_113P62684 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HERVK_113P62684 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HERVK_113P62684 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HERVK_113P62684 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HERVK_113P62684 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HERVK_113P62684 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HERVK_113P62684 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HERVK_113P62684 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HERVK_113P62684 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HERVK_113P62684 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HERVK_113P62684 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HERVK_113P62684 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HERVK_113P62684 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HERVK_113P62684 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HERVK_113P62684 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HERVK_113P62684 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERVK_113P62684 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERVK_113P62684 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERVK_113P62684 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERVK_113P62684 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERVK_113P62684 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERVK_113P62684 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERVK_113P62684 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERVK_113P62684 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERVK_113P62684 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERVK_113P62684 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HERVK_113P62684 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERVK_113P62684 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HERVK_113P62684 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERVK_113P62684 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERVK_113P62684 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERVK_113P62684 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERVK_113P62684 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERVK_113P62684 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HERVK_113P62684 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HERVK_113P62684 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERVK_113P62684 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERVK_113P62684 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERVK_113P62684 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERVK_113P62684 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERVK_113P62684 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERVK_113P62684 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERVK_113P62684 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERVK_113P62684 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERVK_113P62684 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERVK_113P62684 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERVK_113P62684 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
HERVK_113P62684 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
HERVK_113P62684 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HERVK_113P62684 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HERVK_113P62684 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HERVK_113P62684 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HERVK_113P62684 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HERVK_113P62684 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HERVK_113P62684 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HERVK_113P62684 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HERVK_113P62684 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HERVK_113P62684 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HERVK_113P62684 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HERVK_113P62684 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HERVK_113P62684 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HERVK_113P62684 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HERVK_113P62684 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HERVK_113P62684 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HERVK_113P62684 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HERVK_113P62684 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HERVK_113P62684 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HERVK_113P62684 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HERVK_113P62684 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HERVK_113P62684 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HERVK_113P62684 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HERVK_113P62684 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HERVK_113P62684 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HERVK_113P62684 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HERVK_113P62684 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HERVK_113P62684 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HERVK_113P62684 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HERVK_113P62684 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HERVK_113P62684 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HERVK_113P62684 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HERVK_113P62684 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HERVK_113P62684 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HERVK_113P62684 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HERVK_113P62684 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HERVK_113P62684 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HERVK_113P62684 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HERVK_113P62684 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HERVK_113P62684 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HERVK_113P62684 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HERVK_113P62684 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HERVK_113P62684 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HERVK_113P62684 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HERVK_113P62684 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HERVK_113P62684 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HERVK_113P62684 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HERVK_113P62684 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HERVK_113P62684 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms