Protein–RNA interactions for Protein: P61576

HERV-K104, Endogenous retrovirus group K member 104 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERV-K104P61576 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms