Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms