Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms