Protein–RNA interactions for Protein: P55196

AFDN, Afadin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFDNP55196 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AFDNP55196 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AFDNP55196 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
AFDNP55196 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
AFDNP55196 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
AFDNP55196 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AFDNP55196 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
AFDNP55196 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
AFDNP55196 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
AFDNP55196 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AFDNP55196 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AFDNP55196 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AFDNP55196 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
AFDNP55196 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AFDNP55196 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
AFDNP55196 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
AFDNP55196 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
AFDNP55196 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
AFDNP55196 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
AFDNP55196 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
AFDNP55196 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
AFDNP55196 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AFDNP55196 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AFDNP55196 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AFDNP55196 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AFDNP55196 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AFDNP55196 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AFDNP55196 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AFDNP55196 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AFDNP55196 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
AFDNP55196 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AFDNP55196 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AFDNP55196 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AFDNP55196 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AFDNP55196 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AFDNP55196 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AFDNP55196 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AFDNP55196 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AFDNP55196 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AFDNP55196 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AFDNP55196 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AFDNP55196 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AFDNP55196 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AFDNP55196 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AFDNP55196 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AFDNP55196 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AFDNP55196 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AFDNP55196 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AFDNP55196 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AFDNP55196 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AFDNP55196 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AFDNP55196 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AFDNP55196 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AFDNP55196 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AFDNP55196 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AFDNP55196 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AFDNP55196 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AFDNP55196 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AFDNP55196 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AFDNP55196 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AFDNP55196 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AFDNP55196 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AFDNP55196 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AFDNP55196 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AFDNP55196 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AFDNP55196 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AFDNP55196 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AFDNP55196 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AFDNP55196 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
AFDNP55196 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AFDNP55196 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AFDNP55196 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AFDNP55196 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AFDNP55196 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AFDNP55196 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AFDNP55196 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AFDNP55196 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AFDNP55196 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
AFDNP55196 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AFDNP55196 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AFDNP55196 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AFDNP55196 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AFDNP55196 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AFDNP55196 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AFDNP55196 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AFDNP55196 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
AFDNP55196 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
AFDNP55196 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
AFDNP55196 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
AFDNP55196 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AFDNP55196 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AFDNP55196 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
AFDNP55196 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AFDNP55196 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
AFDNP55196 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
AFDNP55196 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
AFDNP55196 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AFDNP55196 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
AFDNP55196 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AFDNP55196 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms