Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
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PGGT1BP53609 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
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