Protein–RNA interactions for Protein: P52952

NKX2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-5P52952 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms