Protein–RNA interactions for Protein: P52209

PGD, 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGDP52209 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PGDP52209 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PGDP52209 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PGDP52209 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PGDP52209 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PGDP52209 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PGDP52209 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PGDP52209 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PGDP52209 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PGDP52209 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PGDP52209 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PGDP52209 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PGDP52209 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PGDP52209 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PGDP52209 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PGDP52209 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PGDP52209 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PGDP52209 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PGDP52209 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PGDP52209 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PGDP52209 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PGDP52209 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PGDP52209 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PGDP52209 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PGDP52209 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PGDP52209 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PGDP52209 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PGDP52209 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PGDP52209 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PGDP52209 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PGDP52209 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PGDP52209 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PGDP52209 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PGDP52209 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PGDP52209 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PGDP52209 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PGDP52209 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PGDP52209 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PGDP52209 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PGDP52209 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PGDP52209 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PGDP52209 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PGDP52209 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PGDP52209 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PGDP52209 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PGDP52209 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PGDP52209 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PGDP52209 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PGDP52209 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PGDP52209 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PGDP52209 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PGDP52209 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PGDP52209 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PGDP52209 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PGDP52209 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PGDP52209 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PGDP52209 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PGDP52209 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PGDP52209 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PGDP52209 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PGDP52209 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PGDP52209 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PGDP52209 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PGDP52209 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PGDP52209 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PGDP52209 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PGDP52209 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PGDP52209 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PGDP52209 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PGDP52209 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PGDP52209 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PGDP52209 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PGDP52209 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PGDP52209 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PGDP52209 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PGDP52209 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PGDP52209 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PGDP52209 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PGDP52209 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PGDP52209 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PGDP52209 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PGDP52209 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PGDP52209 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PGDP52209 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PGDP52209 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PGDP52209 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PGDP52209 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PGDP52209 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PGDP52209 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PGDP52209 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PGDP52209 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PGDP52209 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PGDP52209 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PGDP52209 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PGDP52209 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PGDP52209 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PGDP52209 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PGDP52209 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PGDP52209 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PGDP52209 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms