Protein–RNA interactions for Protein: P48506

GCLC, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLCP48506 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GCLCP48506 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GCLCP48506 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GCLCP48506 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GCLCP48506 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GCLCP48506 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GCLCP48506 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GCLCP48506 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GCLCP48506 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GCLCP48506 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GCLCP48506 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GCLCP48506 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GCLCP48506 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GCLCP48506 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GCLCP48506 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GCLCP48506 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GCLCP48506 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GCLCP48506 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GCLCP48506 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GCLCP48506 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GCLCP48506 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GCLCP48506 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GCLCP48506 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GCLCP48506 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GCLCP48506 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GCLCP48506 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GCLCP48506 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GCLCP48506 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GCLCP48506 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GCLCP48506 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GCLCP48506 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GCLCP48506 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GCLCP48506 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GCLCP48506 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GCLCP48506 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GCLCP48506 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GCLCP48506 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GCLCP48506 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GCLCP48506 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GCLCP48506 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
GCLCP48506 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GCLCP48506 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GCLCP48506 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GCLCP48506 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GCLCP48506 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GCLCP48506 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GCLCP48506 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GCLCP48506 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GCLCP48506 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GCLCP48506 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GCLCP48506 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GCLCP48506 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GCLCP48506 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
GCLCP48506 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GCLCP48506 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GCLCP48506 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GCLCP48506 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GCLCP48506 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GCLCP48506 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GCLCP48506 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GCLCP48506 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GCLCP48506 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GCLCP48506 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GCLCP48506 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GCLCP48506 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GCLCP48506 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GCLCP48506 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GCLCP48506 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GCLCP48506 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GCLCP48506 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GCLCP48506 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GCLCP48506 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GCLCP48506 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GCLCP48506 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GCLCP48506 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GCLCP48506 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GCLCP48506 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GCLCP48506 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GCLCP48506 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GCLCP48506 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GCLCP48506 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GCLCP48506 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GCLCP48506 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GCLCP48506 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GCLCP48506 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GCLCP48506 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GCLCP48506 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GCLCP48506 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GCLCP48506 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GCLCP48506 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GCLCP48506 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GCLCP48506 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GCLCP48506 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GCLCP48506 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GCLCP48506 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GCLCP48506 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GCLCP48506 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GCLCP48506 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GCLCP48506 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GCLCP48506 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms