Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ME1P48163 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ME1P48163 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ME1P48163 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ME1P48163 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ME1P48163 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ME1P48163 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ME1P48163 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ME1P48163 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ME1P48163 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ME1P48163 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ME1P48163 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ME1P48163 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ME1P48163 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ME1P48163 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ME1P48163 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ME1P48163 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ME1P48163 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ME1P48163 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ME1P48163 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ME1P48163 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ME1P48163 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ME1P48163 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ME1P48163 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ME1P48163 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ME1P48163 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ME1P48163 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ME1P48163 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ME1P48163 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ME1P48163 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ME1P48163 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ME1P48163 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ME1P48163 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ME1P48163 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ME1P48163 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ME1P48163 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ME1P48163 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ME1P48163 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ME1P48163 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ME1P48163 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ME1P48163 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ME1P48163 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ME1P48163 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ME1P48163 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ME1P48163 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ME1P48163 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ME1P48163 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ME1P48163 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ME1P48163 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ME1P48163 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ME1P48163 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ME1P48163 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ME1P48163 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ME1P48163 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ME1P48163 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ME1P48163 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ME1P48163 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ME1P48163 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ME1P48163 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ME1P48163 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ME1P48163 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ME1P48163 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ME1P48163 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ME1P48163 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ME1P48163 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ME1P48163 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ME1P48163 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ME1P48163 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ME1P48163 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ME1P48163 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ME1P48163 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ME1P48163 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ME1P48163 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ME1P48163 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ME1P48163 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ME1P48163 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ME1P48163 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ME1P48163 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ME1P48163 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ME1P48163 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ME1P48163 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ME1P48163 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ME1P48163 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ME1P48163 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ME1P48163 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ME1P48163 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ME1P48163 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ME1P48163 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ME1P48163 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ME1P48163 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ME1P48163 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ME1P48163 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ME1P48163 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ME1P48163 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ME1P48163 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ME1P48163 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ME1P48163 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ME1P48163 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ME1P48163 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ME1P48163 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms