Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms