Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPOP30536 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPOP30536 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPOP30536 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPOP30536 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPOP30536 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPOP30536 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPOP30536 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPOP30536 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPOP30536 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPOP30536 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPOP30536 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPOP30536 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPOP30536 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPOP30536 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPOP30536 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPOP30536 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPOP30536 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPOP30536 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPOP30536 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPOP30536 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPOP30536 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPOP30536 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPOP30536 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPOP30536 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPOP30536 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPOP30536 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPOP30536 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPOP30536 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPOP30536 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPOP30536 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPOP30536 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPOP30536 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPOP30536 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPOP30536 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPOP30536 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPOP30536 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPOP30536 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPOP30536 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPOP30536 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPOP30536 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPOP30536 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPOP30536 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPOP30536 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPOP30536 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPOP30536 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPOP30536 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPOP30536 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPOP30536 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPOP30536 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPOP30536 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPOP30536 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPOP30536 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPOP30536 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPOP30536 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPOP30536 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPOP30536 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPOP30536 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPOP30536 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPOP30536 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPOP30536 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPOP30536 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPOP30536 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPOP30536 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPOP30536 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSPOP30536 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSPOP30536 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSPOP30536 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSPOP30536 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSPOP30536 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSPOP30536 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSPOP30536 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSPOP30536 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSPOP30536 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSPOP30536 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSPOP30536 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSPOP30536 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSPOP30536 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSPOP30536 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSPOP30536 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSPOP30536 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSPOP30536 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSPOP30536 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSPOP30536 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSPOP30536 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSPOP30536 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TSPOP30536 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSPOP30536 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSPOP30536 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSPOP30536 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSPOP30536 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSPOP30536 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSPOP30536 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSPOP30536 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSPOP30536 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSPOP30536 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSPOP30536 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSPOP30536 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSPOP30536 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSPOP30536 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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