Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CNGA1P29973 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CNGA1P29973 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CNGA1P29973 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNGA1P29973 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNGA1P29973 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNGA1P29973 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNGA1P29973 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNGA1P29973 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms