Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms