Protein–RNA interactions for Protein: P29536

LMOD1, Leiomodin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD1P29536 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LMOD1P29536 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LMOD1P29536 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LMOD1P29536 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LMOD1P29536 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LMOD1P29536 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LMOD1P29536 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LMOD1P29536 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LMOD1P29536 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LMOD1P29536 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LMOD1P29536 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LMOD1P29536 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LMOD1P29536 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LMOD1P29536 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LMOD1P29536 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LMOD1P29536 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LMOD1P29536 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LMOD1P29536 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LMOD1P29536 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LMOD1P29536 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LMOD1P29536 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMOD1P29536 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMOD1P29536 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMOD1P29536 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMOD1P29536 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMOD1P29536 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMOD1P29536 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMOD1P29536 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMOD1P29536 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMOD1P29536 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMOD1P29536 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMOD1P29536 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMOD1P29536 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
LMOD1P29536 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMOD1P29536 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMOD1P29536 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMOD1P29536 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMOD1P29536 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMOD1P29536 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMOD1P29536 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMOD1P29536 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMOD1P29536 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMOD1P29536 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMOD1P29536 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMOD1P29536 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMOD1P29536 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMOD1P29536 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMOD1P29536 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMOD1P29536 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMOD1P29536 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMOD1P29536 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMOD1P29536 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
LMOD1P29536 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMOD1P29536 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMOD1P29536 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMOD1P29536 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMOD1P29536 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMOD1P29536 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMOD1P29536 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMOD1P29536 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMOD1P29536 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMOD1P29536 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
LMOD1P29536 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMOD1P29536 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMOD1P29536 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMOD1P29536 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMOD1P29536 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMOD1P29536 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMOD1P29536 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMOD1P29536 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMOD1P29536 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMOD1P29536 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMOD1P29536 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
LMOD1P29536 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMOD1P29536 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMOD1P29536 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMOD1P29536 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMOD1P29536 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMOD1P29536 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMOD1P29536 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMOD1P29536 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
LMOD1P29536 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMOD1P29536 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMOD1P29536 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMOD1P29536 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMOD1P29536 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMOD1P29536 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMOD1P29536 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMOD1P29536 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMOD1P29536 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMOD1P29536 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMOD1P29536 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMOD1P29536 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMOD1P29536 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMOD1P29536 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMOD1P29536 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMOD1P29536 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMOD1P29536 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMOD1P29536 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMOD1P29536 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms