Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DUSP1P28562 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP1P28562 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms