Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PEX2P28328 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PEX2P28328 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PEX2P28328 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PEX2P28328 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PEX2P28328 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PEX2P28328 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PEX2P28328 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PEX2P28328 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PEX2P28328 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PEX2P28328 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PEX2P28328 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PEX2P28328 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PEX2P28328 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PEX2P28328 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PEX2P28328 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PEX2P28328 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PEX2P28328 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PEX2P28328 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PEX2P28328 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PEX2P28328 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PEX2P28328 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PEX2P28328 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PEX2P28328 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PEX2P28328 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PEX2P28328 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PEX2P28328 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PEX2P28328 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PEX2P28328 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PEX2P28328 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PEX2P28328 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PEX2P28328 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PEX2P28328 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PEX2P28328 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PEX2P28328 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PEX2P28328 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PEX2P28328 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PEX2P28328 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PEX2P28328 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PEX2P28328 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PEX2P28328 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PEX2P28328 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PEX2P28328 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PEX2P28328 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PEX2P28328 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PEX2P28328 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PEX2P28328 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PEX2P28328 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PEX2P28328 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PEX2P28328 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PEX2P28328 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PEX2P28328 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PEX2P28328 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PEX2P28328 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PEX2P28328 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PEX2P28328 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PEX2P28328 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PEX2P28328 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PEX2P28328 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PEX2P28328 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PEX2P28328 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PEX2P28328 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PEX2P28328 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PEX2P28328 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PEX2P28328 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PEX2P28328 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PEX2P28328 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PEX2P28328 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PEX2P28328 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PEX2P28328 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PEX2P28328 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PEX2P28328 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PEX2P28328 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PEX2P28328 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PEX2P28328 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PEX2P28328 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PEX2P28328 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PEX2P28328 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PEX2P28328 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PEX2P28328 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PEX2P28328 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PEX2P28328 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PEX2P28328 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PEX2P28328 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PEX2P28328 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PEX2P28328 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PEX2P28328 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PEX2P28328 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PEX2P28328 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PEX2P28328 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PEX2P28328 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PEX2P28328 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PEX2P28328 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PEX2P28328 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PEX2P28328 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PEX2P28328 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PEX2P28328 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PEX2P28328 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PEX2P28328 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PEX2P28328 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms