Protein–RNA interactions for Protein: P26992

CNTFR, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFRP26992 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms