Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHMLP26374 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHMLP26374 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHMLP26374 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHMLP26374 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHMLP26374 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHMLP26374 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHMLP26374 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHMLP26374 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHMLP26374 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHMLP26374 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHMLP26374 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CHMLP26374 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHMLP26374 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHMLP26374 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHMLP26374 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHMLP26374 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHMLP26374 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHMLP26374 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHMLP26374 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHMLP26374 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHMLP26374 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHMLP26374 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHMLP26374 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHMLP26374 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHMLP26374 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHMLP26374 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHMLP26374 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHMLP26374 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHMLP26374 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHMLP26374 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHMLP26374 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHMLP26374 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHMLP26374 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHMLP26374 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHMLP26374 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHMLP26374 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHMLP26374 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CHMLP26374 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHMLP26374 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CHMLP26374 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHMLP26374 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHMLP26374 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHMLP26374 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHMLP26374 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHMLP26374 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHMLP26374 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHMLP26374 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHMLP26374 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHMLP26374 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHMLP26374 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHMLP26374 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHMLP26374 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHMLP26374 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHMLP26374 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHMLP26374 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CHMLP26374 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHMLP26374 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CHMLP26374 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHMLP26374 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CHMLP26374 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CHMLP26374 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CHMLP26374 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHMLP26374 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CHMLP26374 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHMLP26374 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHMLP26374 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHMLP26374 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHMLP26374 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHMLP26374 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHMLP26374 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHMLP26374 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHMLP26374 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHMLP26374 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHMLP26374 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHMLP26374 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHMLP26374 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHMLP26374 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHMLP26374 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHMLP26374 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHMLP26374 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHMLP26374 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHMLP26374 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHMLP26374 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHMLP26374 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHMLP26374 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHMLP26374 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CHMLP26374 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CHMLP26374 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMLP26374 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMLP26374 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMLP26374 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMLP26374 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMLP26374 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMLP26374 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMLP26374 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMLP26374 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMLP26374 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMLP26374 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMLP26374 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms