Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM21P19474 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms