Protein–RNA interactions for Protein: P18564

ITGB6, Integrin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6P18564 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms