Protein–RNA interactions for Protein: P17538

CTRB1, Chymotrypsinogen B, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRB1P17538 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTRB1P17538 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms