Protein–RNA interactions for Protein: P17483

HOXB4, Homeobox protein Hox-B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4P17483 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms